民国29年7月，新四军苏北指挥部成立，载文任三纵队三团政委。新四军军部重建后，他任一师三旅七团政委。他所在的三团、七团都是主力团，有一段时间，指挥员更迭频繁，有时交替衔接不上，由载文主持全面工作。他指挥部队取得一个又一个胜利，战士们说：“吴政委打仗最勇敢，坚决顽强，每次战斗他都和主攻部队冲在最前面。”同年7月，他和黄才胜团长率部东进，协同兄弟部队先后解放黄桥、蒋垛、古溪、加力等地。9月，率部参加姜念战斗，歼敌1000多人。10月初，率部参加黄桥决战，反击中俘敌700余人。在陶勇司令员的指挥下，载文亲临一营一连率主攻部队猛冲，激战一个多小时，活捉敌三十三师师长孙启仁，歼敌2000余人。粟裕表扬说：“你们打得好。黄桥人民永远忘不了你们。”紧接着又率部追击溃军第一一七师达九昼夜，直到东台。

　　民国30年2月，李长江投靠日本侵略军，七团奉命参加讨逆战斗。载文指挥一营从泰州城东面强攻，夺取敌人前沿阵地，使全团顺利攻入泰州城，俘敌100多人。是月，日本侵略军侵占淮安、东台等地，韩德勤乘机占领虹桥、凤谷村策应日军。时有国民党江苏常备二旅旅长吴漱泉率部占领盐城县西部沿荡一带，并将旅部和一个团驻扎蒋营，极力破坏刚建立的抗日民主政权，经常进犯抗日民主根据地，作恶多端。为了扫除抗日障碍，军部发出歼灭这部顽军的战斗命令。新四军二旅一部、三旅七团奉命由王必成旅长统一指挥这次战斗。七团任务是主攻蒋营敌旅部和一个团。4月15日深夜11时发起总攻，七团一营30多条木船秘密前进，载文亲自指挥团部重机枪连掩护一营向敌人三面交叉的火力阵地——蔷薇河与□河交汇处的十字河口进击。经过两小时激战，一营突破敌军水网防御阵地，占领十字河口。为迅速歼灭敌人，载文又亲自到一连突击排指挥战斗，击退敌人三次反扑。正当战斗向敌人纵深发展夺取敌人重要交叉火力阵地时，载文不幸中弹牺牲，时年27岁。

遗体安葬在盐城县小沙庄。抗战胜利后，盐城县人民政府在小沙庄重新立墓建塔。1967年，蒋营公社党委又将烈士遗骨迁葬蒋营烈士陵园。